Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms