Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms