Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUCB2P80303 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NUCB2P80303 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms