Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PITX1P78337 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITX1P78337 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITX1P78337 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITX1P78337 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITX1P78337 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITX1P78337 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITX1P78337 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITX1P78337 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITX1P78337 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITX1P78337 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITX1P78337 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITX1P78337 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITX1P78337 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITX1P78337 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITX1P78337 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITX1P78337 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITX1P78337 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITX1P78337 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITX1P78337 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITX1P78337 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITX1P78337 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITX1P78337 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITX1P78337 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITX1P78337 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITX1P78337 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PITX1P78337 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PITX1P78337 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITX1P78337 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITX1P78337 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITX1P78337 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITX1P78337 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITX1P78337 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX1P78337 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX1P78337 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX1P78337 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX1P78337 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX1P78337 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX1P78337 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX1P78337 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX1P78337 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX1P78337 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX1P78337 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX1P78337 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX1P78337 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX1P78337 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX1P78337 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITX1P78337 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITX1P78337 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITX1P78337 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITX1P78337 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITX1P78337 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITX1P78337 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITX1P78337 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITX1P78337 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITX1P78337 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITX1P78337 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITX1P78337 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITX1P78337 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITX1P78337 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITX1P78337 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITX1P78337 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITX1P78337 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITX1P78337 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITX1P78337 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITX1P78337 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PITX1P78337 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PITX1P78337 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PITX1P78337 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PITX1P78337 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PITX1P78337 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PITX1P78337 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX1P78337 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX1P78337 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX1P78337 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX1P78337 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX1P78337 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX1P78337 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX1P78337 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX1P78337 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX1P78337 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX1P78337 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX1P78337 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX1P78337 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX1P78337 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX1P78337 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX1P78337 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITX1P78337 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITX1P78337 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PITX1P78337 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PITX1P78337 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITX1P78337 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITX1P78337 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITX1P78337 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITX1P78337 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITX1P78337 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITX1P78337 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITX1P78337 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITX1P78337 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITX1P78337 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms