Protein–RNA interactions for Protein: P63124

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P63124 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERV-K104P63124 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P63124 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P63124 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P63124 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P63124 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P63124 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P63124 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P63124 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P63124 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P63124 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P63124 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P63124 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P63124 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HERV-K104P63124 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERV-K104P63124 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERV-K104P63124 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERV-K104P63124 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERV-K104P63124 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERV-K104P63124 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P63124 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P63124 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P63124 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P63124 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P63124 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P63124 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms