Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63121 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms