Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL23P62829 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL23P62829 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL23P62829 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL23P62829 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL23P62829 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL23P62829 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL23P62829 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL23P62829 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL23P62829 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL23P62829 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL23P62829 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL23P62829 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL23P62829 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL23P62829 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL23P62829 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL23P62829 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL23P62829 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL23P62829 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL23P62829 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL23P62829 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL23P62829 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL23P62829 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL23P62829 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL23P62829 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL23P62829 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL23P62829 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL23P62829 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL23P62829 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL23P62829 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL23P62829 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL23P62829 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL23P62829 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL23P62829 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL23P62829 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL23P62829 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL23P62829 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL23P62829 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL23P62829 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL23P62829 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL23P62829 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL23P62829 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL23P62829 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL23P62829 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL23P62829 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL23P62829 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL23P62829 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL23P62829 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL23P62829 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL23P62829 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL23P62829 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL23P62829 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL23P62829 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL23P62829 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL23P62829 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL23P62829 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL23P62829 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL23P62829 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL23P62829 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL23P62829 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL23P62829 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL23P62829 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL23P62829 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL23P62829 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL23P62829 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL23P62829 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL23P62829 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL23P62829 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL23P62829 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL23P62829 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL23P62829 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL23P62829 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL23P62829 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL23P62829 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms