Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPL23AP62750 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms