Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERVK_113P62684 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERVK_113P62684 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms