Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UFM1P61960 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFM1P61960 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UFM1P61960 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFM1P61960 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFM1P61960 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFM1P61960 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UFM1P61960 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UFM1P61960 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFM1P61960 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFM1P61960 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UFM1P61960 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UFM1P61960 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UFM1P61960 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UFM1P61960 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UFM1P61960 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFM1P61960 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFM1P61960 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UFM1P61960 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFM1P61960 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFM1P61960 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UFM1P61960 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UFM1P61960 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
UFM1P61960 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UFM1P61960 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFM1P61960 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFM1P61960 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFM1P61960 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFM1P61960 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFM1P61960 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFM1P61960 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFM1P61960 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFM1P61960 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFM1P61960 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UFM1P61960 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFM1P61960 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFM1P61960 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFM1P61960 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UFM1P61960 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UFM1P61960 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFM1P61960 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFM1P61960 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFM1P61960 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFM1P61960 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFM1P61960 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFM1P61960 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFM1P61960 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFM1P61960 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFM1P61960 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFM1P61960 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UFM1P61960 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFM1P61960 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFM1P61960 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFM1P61960 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFM1P61960 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFM1P61960 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFM1P61960 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFM1P61960 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFM1P61960 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFM1P61960 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFM1P61960 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFM1P61960 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFM1P61960 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UFM1P61960 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms