Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK11-1P61568 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVK11-1P61568 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms