Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERVPABLB-1P60509 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms