Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCCD1P59942 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MCCD1P59942 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms