Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LOXL3P58215 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LOXL3P58215 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms