Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EEFSECP57772 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EEFSECP57772 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms