Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP1S2P56377 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP1S2P56377 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms