Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX9P55771 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX9P55771 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX9P55771 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX9P55771 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX9P55771 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX9P55771 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX9P55771 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX9P55771 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX9P55771 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX9P55771 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX9P55771 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX9P55771 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX9P55771 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX9P55771 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX9P55771 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX9P55771 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX9P55771 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX9P55771 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX9P55771 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX9P55771 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX9P55771 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX9P55771 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX9P55771 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX9P55771 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX9P55771 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAX9P55771 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX9P55771 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX9P55771 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX9P55771 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX9P55771 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX9P55771 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX9P55771 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX9P55771 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX9P55771 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PAX9P55771 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX9P55771 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX9P55771 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX9P55771 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX9P55771 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX9P55771 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX9P55771 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX9P55771 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX9P55771 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX9P55771 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX9P55771 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PAX9P55771 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAX9P55771 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAX9P55771 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAX9P55771 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAX9P55771 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAX9P55771 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAX9P55771 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PAX9P55771 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX9P55771 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX9P55771 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX9P55771 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX9P55771 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX9P55771 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX9P55771 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX9P55771 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX9P55771 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX9P55771 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX9P55771 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX9P55771 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PAX9P55771 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX9P55771 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX9P55771 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX9P55771 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX9P55771 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX9P55771 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX9P55771 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX9P55771 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX9P55771 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX9P55771 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX9P55771 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PAX9P55771 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX9P55771 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX9P55771 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX9P55771 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX9P55771 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX9P55771 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX9P55771 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX9P55771 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX9P55771 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX9P55771 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX9P55771 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX9P55771 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX9P55771 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAX9P55771 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX9P55771 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX9P55771 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX9P55771 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX9P55771 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX9P55771 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX9P55771 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX9P55771 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX9P55771 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX9P55771 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX9P55771 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms