Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRLP54845 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NRLP54845 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRLP54845 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRLP54845 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRLP54845 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRLP54845 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRLP54845 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRLP54845 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRLP54845 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRLP54845 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRLP54845 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRLP54845 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRLP54845 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRLP54845 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRLP54845 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRLP54845 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRLP54845 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRLP54845 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NRLP54845 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NRLP54845 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRLP54845 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRLP54845 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRLP54845 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRLP54845 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRLP54845 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRLP54845 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRLP54845 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRLP54845 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NRLP54845 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRLP54845 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRLP54845 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRLP54845 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRLP54845 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRLP54845 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRLP54845 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRLP54845 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRLP54845 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRLP54845 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRLP54845 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRLP54845 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRLP54845 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRLP54845 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRLP54845 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRLP54845 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRLP54845 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRLP54845 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NRLP54845 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRLP54845 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRLP54845 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRLP54845 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRLP54845 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRLP54845 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRLP54845 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRLP54845 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRLP54845 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRLP54845 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRLP54845 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRLP54845 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRLP54845 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRLP54845 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRLP54845 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRLP54845 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRLP54845 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRLP54845 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRLP54845 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRLP54845 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRLP54845 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NRLP54845 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRLP54845 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRLP54845 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRLP54845 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRLP54845 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRLP54845 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NRLP54845 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRLP54845 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRLP54845 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRLP54845 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRLP54845 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRLP54845 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRLP54845 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRLP54845 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRLP54845 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRLP54845 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRLP54845 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRLP54845 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRLP54845 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRLP54845 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRLP54845 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRLP54845 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRLP54845 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRLP54845 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRLP54845 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRLP54845 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRLP54845 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRLP54845 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRLP54845 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRLP54845 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRLP54845 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NRLP54845 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms