Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAD23BP54727 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms