Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P54278 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS2P54278 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS2P54278 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS2P54278 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS2P54278 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS2P54278 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS2P54278 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS2P54278 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS2P54278 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS2P54278 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS2P54278 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMS2P54278 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMS2P54278 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMS2P54278 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMS2P54278 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS2P54278 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS2P54278 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS2P54278 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS2P54278 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS2P54278 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS2P54278 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS2P54278 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS2P54278 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P54278 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P54278 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P54278 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P54278 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P54278 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P54278 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P54278 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P54278 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P54278 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P54278 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P54278 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P54278 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P54278 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P54278 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMS2P54278 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMS2P54278 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMS2P54278 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMS2P54278 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMS2P54278 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMS2P54278 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMS2P54278 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMS2P54278 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMS2P54278 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMS2P54278 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMS2P54278 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMS2P54278 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMS2P54278 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMS2P54278 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMS2P54278 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMS2P54278 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMS2P54278 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMS2P54278 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMS2P54278 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMS2P54278 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMS2P54278 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMS2P54278 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMS2P54278 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMS2P54278 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMS2P54278 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMS2P54278 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMS2P54278 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMS2P54278 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMS2P54278 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMS2P54278 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMS2P54278 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PMS2P54278 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PMS2P54278 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMS2P54278 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMS2P54278 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMS2P54278 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P54278 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P54278 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P54278 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P54278 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P54278 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P54278 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P54278 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P54278 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P54278 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P54278 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P54278 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P54278 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMS2P54278 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P54278 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P54278 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P54278 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P54278 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P54278 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P54278 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMS2P54278 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMS2P54278 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMS2P54278 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMS2P54278 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMS2P54278 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS2P54278 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMS2P54278 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms