Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIMK1P53667 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK1P53667 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms