Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARFIP2P53365 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms