Protein–RNA interactions for Protein: P53011

SEH1, Nucleoporin SEH1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEH1P53011 YER067C-AYER067C-A 324 nt4.02□□□□□ -1.77
SEH1P53011 TIM21YGR033C 720 nt4.02□□□□□ -1.77
SEH1P53011 NAT2YGR147C 867 nt4.02□□□□□ -1.77
SEH1P53011 SAE3YHR079C-A 276 nt4.02□□□□□ -1.77
SEH1P53011 KTR2YKR061W 1278 nt4.02□□□□□ -1.77
SEH1P53011 YLR402WYLR402W 192 nt4.02□□□□□ -1.77
SEH1P53011 YNR068CYNR068C 819 nt4.02□□□□□ -1.77
SEH1P53011 TFA1YKL028W 1449 nt4.02□□□□□ -1.77
SEH1P53011 CDC6YJL194W 1542 nt4.01□□□□□ -1.77
SEH1P53011 LYP1YNL268W 1836 nt4.01□□□□□ -1.77
SEH1P53011 YGL118CYGL118C 438 nt4.01□□□□□ -1.77
SEH1P53011 YGR079WYGR079W 1113 nt4.01□□□□□ -1.77
SEH1P53011 YET2YMR040W 483 nt4.01□□□□□ -1.77
SEH1P53011 SPO19YPL130W 672 nt4.01□□□□□ -1.77
SEH1P53011 TAF7YMR227C 1773 nt4.01□□□□□ -1.77
SEH1P53011 TCO89YPL180W 2400 nt4.01□□□□□ -1.77
SEH1P53011 ENT1YDL161W 1365 nt4.01□□□□□ -1.77
SEH1P53011 ISR1YPR106W 1332 nt4□□□□□ -1.77
SEH1P53011 MET12YPL023C 1974 nt4□□□□□ -1.77
SEH1P53011 PCL9YDL179W 915 nt4□□□□□ -1.77
SEH1P53011 ISA1YLL027W 753 nt4□□□□□ -1.77
SEH1P53011 NSE1YLR007W 1011 nt4□□□□□ -1.77
SEH1P53011 VTA1YLR181C 993 nt4□□□□□ -1.77
SEH1P53011 MAP1YLR244C 1164 nt4□□□□□ -1.77
SEH1P53011 YNL181WYNL181W 1224 nt4□□□□□ -1.77
SEH1P53011 YER158CYER158C 1722 nt4□□□□□ -1.77
SEH1P53011 EGT2YNL327W 3126 nt3.99□□□□□ -1.77
SEH1P53011 snR57snR57 88 nt3.99□□□□□ -1.77
SEH1P53011 PFA5YDR459C 1125 nt3.99□□□□□ -1.77
SEH1P53011 KRE28YDR532C 1158 nt3.99□□□□□ -1.77
SEH1P53011 BUR6YER159C 429 nt3.99□□□□□ -1.77
SEH1P53011 MOB2YFL034C-B 864 nt3.99□□□□□ -1.77
SEH1P53011 RNA15YGL044C 891 nt3.99□□□□□ -1.77
SEH1P53011 MPC54YOR177C 1395 nt3.99□□□□□ -1.77
SEH1P53011 VHS3YOR054C 2025 nt3.99□□□□□ -1.77
SEH1P53011 DIT2YDR402C 1470 nt3.98□□□□□ -1.77
SEH1P53011 FRT2YAL028W 1587 nt3.98□□□□□ -1.77
SEH1P53011 ATP5YDR298C 639 nt3.98□□□□□ -1.77
SEH1P53011 RPL8AYHL033C 771 nt3.98□□□□□ -1.77
SEH1P53011 YKR047WYKR047W 306 nt3.98□□□□□ -1.77
SEH1P53011 RPS31YLR167W 459 nt3.98□□□□□ -1.77
SEH1P53011 PEX12YMR026C 1200 nt3.98□□□□□ -1.77
SEH1P53011 YPR015CYPR015C 744 nt3.98□□□□□ -1.77
SEH1P53011 BSD2YBR290W 966 nt3.98□□□□□ -1.77
SEH1P53011 YMR221CYMR221C 1515 nt3.98□□□□□ -1.77
SEH1P53011 THI7YLR237W 1797 nt3.98□□□□□ -1.77
SEH1P53011 FOX2YKR009C 2703 nt3.98□□□□□ -1.77
SEH1P53011 PRM2YIL037C 1971 nt3.98□□□□□ -1.77
SEH1P53011 SIR1YKR101W 1965 nt3.98□□□□□ -1.77
SEH1P53011 UTP6YDR449C 1323 nt3.97□□□□□ -1.77
SEH1P53011 GIP4YAL031C 2283 nt3.97□□□□□ -1.77
SEH1P53011 PRD1YCL057W 2139 nt3.97□□□□□ -1.77
SEH1P53011 YML020WYML020W 1995 nt3.97□□□□□ -1.77
SEH1P53011 YCR050CYCR050C 309 nt3.97□□□□□ -1.77
SEH1P53011 SRB5YGR104C 924 nt3.97□□□□□ -1.77
SEH1P53011 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt3.97□□□□□ -1.77
SEH1P53011 PSR1YLL010C 1284 nt3.97□□□□□ -1.77
SEH1P53011 POP4YBR257W 840 nt3.97□□□□□ -1.77
SEH1P53011 PUT2YHR037W 1728 nt3.97□□□□□ -1.77
SEH1P53011 TCM62YBR044C 1719 nt3.97□□□□□ -1.77
SEH1P53011 AZR1YGR224W 1842 nt3.97□□□□□ -1.77
SEH1P53011 SOF1YLL011W 1470 nt3.97□□□□□ -1.77
SEH1P53011 IMD2YHR216W 1572 nt3.97□□□□□ -1.77
SEH1P53011 YPK9YOR291W 4419 nt3.96□□□□□ -1.77
SEH1P53011 STB3YDR169C 1542 nt3.96□□□□□ -1.78
SEH1P53011 NUP133YKR082W 3474 nt3.96□□□□□ -1.78
SEH1P53011 MNN4YKL201C 3537 nt3.96□□□□□ -1.78
SEH1P53011 YFT2YDR319C 825 nt3.96□□□□□ -1.78
SEH1P53011 ANT1YPR128C 987 nt3.96□□□□□ -1.78
SEH1P53011 NUP2YLR335W 2163 nt3.96□□□□□ -1.78
SEH1P53011 CDC9YDL164C 2268 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 CNA1YLR433C 1662 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 NUP42YDR192C 1293 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 CAF16YFL028C 870 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 VMA22YHR060W 546 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 YJL218WYJL218W 591 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 CNB1YKL190W 528 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 RPS1BYML063W 768 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 SPC24YMR117C 642 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 YOL050CYOL050C 321 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 YOR379CYOR379C 339 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 NCE102YPR149W 522 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 RER1YCL001W 567 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 TRK1YJL129C 3708 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 PIM1YBL022C 3402 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 TAF12YDR145W 1620 nt3.95□□□□□ -1.78
SEH1P53011 GLN4YOR168W 2430 nt3.94□□□□□ -1.78
SEH1P53011 EAR1YMR171C 1653 nt3.94□□□□□ -1.78
SEH1P53011 snR7-SsnR7-S 179 nt3.94□□□□□ -1.78
SEH1P53011 ERV14YGL054C 417 nt3.94□□□□□ -1.78
SEH1P53011 YGL193CYGL193C 312 nt3.94□□□□□ -1.78
SEH1P53011 CKS1YBR135W 453 nt3.94□□□□□ -1.78
SEH1P53011 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.94□□□□□ -1.78
SEH1P53011 ARC40YBR234C 1155 nt3.94□□□□□ -1.78
SEH1P53011 PDR5YOR153W 4536 nt3.94□□□□□ -1.78
SEH1P53011 SPT23YKL020C 3249 nt3.93□□□□□ -1.78
SEH1P53011 GAL11YOL051W 3246 nt3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.4 ms