Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.062e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SNTB1-203ENST00000519177 1962 ntTSL 1 (best)26.6■■□□□ 1.852e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.462e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 RPS15A-211ENST00000575669 3828 nt10.45□□□□□ -0.741e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.849e-8■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 MORF4L1-204ENST00000557961 591 ntTSL 237.57■■■■□ 3.69e-8■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 MORF4L1-220ENST00000559930 678 ntTSL 429.56■■■□□ 2.329e-8■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.249e-8■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.859e-8■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 MORF4L1-210ENST00000558893 1209 ntTSL 1 (best)19.55■□□□□ 0.729e-8■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 MORF4L1-208ENST00000558746 874 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.629e-8■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 MORF4L1-209ENST00000558830 616 ntTSL 311.34□□□□□ -0.599e-8■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 MORF4L1-214ENST00000559258 1047 ntTSL 28.83□□□□□ -19e-8■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -19e-8■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 MORF4L1-206ENST00000558522 1074 ntTSL 27.72□□□□□ -1.179e-8■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 MORF4L1-223ENST00000561171 933 ntTSL 27.72□□□□□ -1.179e-8■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 MORF4L1-216ENST00000559619 448 ntTSL 26.96□□□□□ -1.39e-8■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.11e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 GDI2-206ENST00000456041 918 ntTSL 518.86■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 GDI2-202ENST00000380181 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.714e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.694e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.634e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 DNAJB6-208ENST00000441561 1022 ntTSL 524.61■■□□□ 1.535e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.945e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 DNAJB6-202ENST00000412557 506 ntTSL 318.31■□□□□ 0.525e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 DNAJB6-207ENST00000441291 614 ntTSL 317.83■□□□□ 0.445e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 DNAJB6-203ENST00000417758 852 ntTSL 517.32■□□□□ 0.365e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 ZFX-207ENST00000459724 673 ntTSL 536.94■■■■□ 3.52e-14■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 PRKAR1B-205ENST00000414568 752 ntTSL 525.76■■□□□ 1.712e-6■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.662e-14■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 ZNF680-204ENST00000473601 566 ntTSL 217.22■□□□□ 0.359e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SMG6-218ENST00000575454 652 ntTSL 314.66□□□□□ -0.062e-14■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SMG6-202ENST00000354901 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.392e-14■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.682e-14■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.812e-14■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.222e-14■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 EXOC6B-204ENST00000464347 464 ntTSL 57.45□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.242e-14■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.372e-14■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SMG6-208ENST00000570874 533 ntTSL 44.85□□□□□ -1.632e-14■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 ZC3H18-212ENST00000569435 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 526.6■■□□□ 1.852e-6■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 ZC3H18-210ENST00000567085 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.62■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.526e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 UNC45A-207ENST00000487875 2641 ntTSL 220.19■□□□□ 0.826e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.638e-17■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SLTM-206ENST00000480144 2277 ntTSL 217.46■□□□□ 0.396e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.286e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SLTM-220ENST00000559880 717 ntTSL 316.61■□□□□ 0.256e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SLTM-226ENST00000628684 1040 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.046e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SLTM-212ENST00000557924 3021 ntTSL 214.66□□□□□ -0.066e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.118e-17■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SLTM-202ENST00000380516 4147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.166e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SLTM-213ENST00000557950 924 ntTSL 311.79□□□□□ -0.526e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SLTM-208ENST00000492526 3022 ntTSL 210.31□□□□□ -0.766e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SLTM-215ENST00000558486 585 ntTSL 49.36□□□□□ -0.916e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SLTM-219ENST00000559305 559 ntTSL 48.75□□□□□ -1.016e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SLTM-201ENST00000249736 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.51□□□□□ -1.056e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SLTM-224ENST00000560682 495 ntTSL 38.04□□□□□ -1.126e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SLTM-217ENST00000558756 896 ntTSL 56.93□□□□□ -1.36e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.326e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 TAX1BP1-204ENST00000416801 2221 ntTSL 26.09□□□□□ -1.446e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.496e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.56e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.02□□□□□ -1.616e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 SLTM-223ENST00000560532 559 ntTSL 44.86□□□□□ -1.636e-9■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.081e-6■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 331.51■■■□□ 2.631e-6■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.431e-6■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 528.91■■■□□ 2.221e-6■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.21e-6■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 AC091976.1-204ENST00000503504 492 ntTSL 517.46■□□□□ 0.394e-11■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.334e-11■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 CLMN-203ENST00000555336 718 ntTSL 57.5□□□□□ -1.219e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 DNAJB6-213ENST00000468928 900 ntTSL 322.84■■□□□ 1.255e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.129e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 ABCD3-204ENST00000468860 661 ntTSL 328.7■■■□□ 2.187e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.798e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.218e-7■■■■■ 29.9
HNRNPMP52272 STRN3-207ENST00000555358 2208 ntTSL 1 (best)33.84■■■■□ 3.014e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.514e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 220.88■□□□□ 0.933e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 ATF7IP2-216ENST00000569900 559 ntTSL 425.92■■□□□ 1.748e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 ATF7IP2-207ENST00000561932 538 ntTSL 424.3■■□□□ 1.488e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 ATF7IP2-210ENST00000562527 625 ntTSL 315.65■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 ATF7IP2-217ENST00000569939 564 ntTSL 414.03□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 ATF7IP2-208ENST00000562102 558 ntTSL 49.84□□□□□ -0.838e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 ATF7IP2-211ENST00000564797 450 ntTSL 35.82□□□□□ -1.488e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.559e-7■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 PHLPP1-203ENST00000497351 572 ntTSL 415.56■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.991e-16■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.755e-8■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.681e-16■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 AHSA2-205ENST00000471542 1971 ntTSL 220.87■□□□□ 0.931e-16■■■■■ 29.8
HNRNPMP52272 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.881e-16■■■■■ 29.8
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 198.4 ms