Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms