Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB27AP51159 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms