Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERFP50548 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERFP50548 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERFP50548 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERFP50548 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERFP50548 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERFP50548 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERFP50548 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERFP50548 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERFP50548 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERFP50548 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERFP50548 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERFP50548 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERFP50548 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERFP50548 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERFP50548 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERFP50548 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERFP50548 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERFP50548 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERFP50548 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERFP50548 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERFP50548 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERFP50548 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERFP50548 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERFP50548 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERFP50548 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERFP50548 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERFP50548 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERFP50548 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERFP50548 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERFP50548 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERFP50548 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERFP50548 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERFP50548 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERFP50548 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERFP50548 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERFP50548 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERFP50548 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERFP50548 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERFP50548 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERFP50548 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERFP50548 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERFP50548 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERFP50548 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERFP50548 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERFP50548 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERFP50548 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERFP50548 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERFP50548 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERFP50548 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERFP50548 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERFP50548 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERFP50548 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERFP50548 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERFP50548 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERFP50548 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERFP50548 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERFP50548 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERFP50548 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERFP50548 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERFP50548 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERFP50548 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERFP50548 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERFP50548 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERFP50548 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERFP50548 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERFP50548 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERFP50548 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERFP50548 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERFP50548 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERFP50548 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERFP50548 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERFP50548 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ERFP50548 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERFP50548 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERFP50548 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERFP50548 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERFP50548 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERFP50548 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERFP50548 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERFP50548 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms