Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CRIP1P50238 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRIP1P50238 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms