Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIG4P49917 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIG4P49917 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIG4P49917 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIG4P49917 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIG4P49917 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIG4P49917 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIG4P49917 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIG4P49917 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LIG4P49917 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIG4P49917 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIG4P49917 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIG4P49917 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIG4P49917 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIG4P49917 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIG4P49917 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIG4P49917 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIG4P49917 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIG4P49917 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIG4P49917 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIG4P49917 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIG4P49917 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIG4P49917 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIG4P49917 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIG4P49917 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIG4P49917 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LIG4P49917 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIG4P49917 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIG4P49917 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIG4P49917 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LIG4P49917 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIG4P49917 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIG4P49917 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LIG4P49917 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LIG4P49917 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIG4P49917 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIG4P49917 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIG4P49917 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIG4P49917 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIG4P49917 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIG4P49917 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LIG4P49917 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIG4P49917 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIG4P49917 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LIG4P49917 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIG4P49917 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIG4P49917 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LIG4P49917 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIG4P49917 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIG4P49917 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIG4P49917 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LIG4P49917 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIG4P49917 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIG4P49917 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIG4P49917 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LIG4P49917 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIG4P49917 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIG4P49917 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIG4P49917 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIG4P49917 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIG4P49917 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIG4P49917 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIG4P49917 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIG4P49917 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIG4P49917 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIG4P49917 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIG4P49917 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LIG4P49917 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIG4P49917 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIG4P49917 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LIG4P49917 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIG4P49917 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIG4P49917 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIG4P49917 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIG4P49917 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIG4P49917 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIG4P49917 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIG4P49917 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIG4P49917 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIG4P49917 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LIG4P49917 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIG4P49917 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIG4P49917 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIG4P49917 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIG4P49917 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIG4P49917 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIG4P49917 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LIG4P49917 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIG4P49917 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIG4P49917 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIG4P49917 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIG4P49917 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIG4P49917 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIG4P49917 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIG4P49917 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIG4P49917 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LIG4P49917 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIG4P49917 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LIG4P49917 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LIG4P49917 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms