Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTCFP49711 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTCFP49711 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CTCFP49711 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTCFP49711 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTCFP49711 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CTCFP49711 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CTCFP49711 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTCFP49711 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CTCFP49711 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTCFP49711 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTCFP49711 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTCFP49711 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTCFP49711 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTCFP49711 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTCFP49711 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTCFP49711 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTCFP49711 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTCFP49711 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTCFP49711 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CTCFP49711 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CTCFP49711 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CTCFP49711 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTCFP49711 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTCFP49711 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTCFP49711 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTCFP49711 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTCFP49711 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTCFP49711 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTCFP49711 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTCFP49711 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTCFP49711 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTCFP49711 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CTCFP49711 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTCFP49711 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTCFP49711 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTCFP49711 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTCFP49711 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTCFP49711 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTCFP49711 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTCFP49711 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTCFP49711 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CTCFP49711 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTCFP49711 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTCFP49711 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTCFP49711 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTCFP49711 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTCFP49711 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTCFP49711 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTCFP49711 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTCFP49711 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTCFP49711 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTCFP49711 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTCFP49711 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CTCFP49711 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CTCFP49711 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTCFP49711 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTCFP49711 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTCFP49711 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTCFP49711 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTCFP49711 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CTCFP49711 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTCFP49711 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTCFP49711 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTCFP49711 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CTCFP49711 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTCFP49711 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTCFP49711 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTCFP49711 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTCFP49711 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CTCFP49711 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTCFP49711 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTCFP49711 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTCFP49711 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTCFP49711 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CTCFP49711 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTCFP49711 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTCFP49711 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTCFP49711 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTCFP49711 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTCFP49711 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTCFP49711 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTCFP49711 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTCFP49711 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTCFP49711 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTCFP49711 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTCFP49711 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTCFP49711 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTCFP49711 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTCFP49711 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTCFP49711 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTCFP49711 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CTCFP49711 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTCFP49711 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTCFP49711 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTCFP49711 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTCFP49711 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTCFP49711 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTCFP49711 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTCFP49711 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms