Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PXNP49023 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PXNP49023 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PXNP49023 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PXNP49023 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PXNP49023 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PXNP49023 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PXNP49023 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PXNP49023 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PXNP49023 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PXNP49023 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PXNP49023 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PXNP49023 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PXNP49023 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PXNP49023 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PXNP49023 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PXNP49023 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PXNP49023 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PXNP49023 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PXNP49023 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PXNP49023 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXNP49023 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXNP49023 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXNP49023 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXNP49023 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXNP49023 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXNP49023 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXNP49023 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXNP49023 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXNP49023 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXNP49023 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXNP49023 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXNP49023 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXNP49023 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXNP49023 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXNP49023 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PXNP49023 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PXNP49023 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PXNP49023 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PXNP49023 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PXNP49023 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PXNP49023 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PXNP49023 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PXNP49023 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PXNP49023 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXNP49023 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXNP49023 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXNP49023 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXNP49023 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXNP49023 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXNP49023 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXNP49023 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXNP49023 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXNP49023 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXNP49023 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXNP49023 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXNP49023 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXNP49023 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXNP49023 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXNP49023 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PXNP49023 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PXNP49023 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PXNP49023 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PXNP49023 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PXNP49023 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PXNP49023 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PXNP49023 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PXNP49023 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PXNP49023 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PXNP49023 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PXNP49023 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PXNP49023 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PXNP49023 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PXNP49023 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PXNP49023 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PXNP49023 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PXNP49023 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PXNP49023 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PXNP49023 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PXNP49023 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PXNP49023 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PXNP49023 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PXNP49023 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PXNP49023 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PXNP49023 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PXNP49023 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PXNP49023 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PXNP49023 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PXNP49023 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PXNP49023 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PXNP49023 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PXNP49023 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PXNP49023 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms