Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD2P49005 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD2P49005 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD2P49005 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD2P49005 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD2P49005 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD2P49005 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD2P49005 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD2P49005 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD2P49005 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD2P49005 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD2P49005 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD2P49005 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD2P49005 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD2P49005 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD2P49005 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD2P49005 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD2P49005 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLD2P49005 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLD2P49005 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLD2P49005 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLD2P49005 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD2P49005 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD2P49005 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD2P49005 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD2P49005 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD2P49005 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD2P49005 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD2P49005 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD2P49005 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD2P49005 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLD2P49005 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD2P49005 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD2P49005 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD2P49005 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD2P49005 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD2P49005 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD2P49005 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD2P49005 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD2P49005 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD2P49005 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD2P49005 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD2P49005 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLD2P49005 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLD2P49005 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD2P49005 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD2P49005 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD2P49005 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD2P49005 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD2P49005 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD2P49005 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD2P49005 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD2P49005 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD2P49005 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD2P49005 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD2P49005 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLD2P49005 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD2P49005 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD2P49005 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD2P49005 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD2P49005 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD2P49005 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD2P49005 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD2P49005 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD2P49005 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD2P49005 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD2P49005 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD2P49005 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD2P49005 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD2P49005 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD2P49005 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD2P49005 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD2P49005 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLD2P49005 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD2P49005 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD2P49005 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD2P49005 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD2P49005 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD2P49005 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD2P49005 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD2P49005 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD2P49005 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLD2P49005 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms