Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCLCP48506 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCLCP48506 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCLCP48506 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLCP48506 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLCP48506 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLCP48506 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLCP48506 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLCP48506 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLCP48506 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLCP48506 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLCP48506 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLCP48506 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLCP48506 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLCP48506 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLCP48506 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLCP48506 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GCLCP48506 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCLCP48506 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCLCP48506 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCLCP48506 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCLCP48506 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCLCP48506 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCLCP48506 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLCP48506 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLCP48506 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLCP48506 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLCP48506 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLCP48506 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLCP48506 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLCP48506 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLCP48506 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLCP48506 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLCP48506 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLCP48506 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCLCP48506 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLCP48506 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLCP48506 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLCP48506 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLCP48506 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLCP48506 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLCP48506 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GCLCP48506 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCLCP48506 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCLCP48506 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCLCP48506 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCLCP48506 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCLCP48506 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCLCP48506 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCLCP48506 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCLCP48506 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCLCP48506 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCLCP48506 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GCLCP48506 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCLCP48506 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCLCP48506 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCLCP48506 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCLCP48506 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCLCP48506 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCLCP48506 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCLCP48506 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCLCP48506 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCLCP48506 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCLCP48506 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCLCP48506 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCLCP48506 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLCP48506 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLCP48506 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLCP48506 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLCP48506 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLCP48506 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLCP48506 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLCP48506 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLCP48506 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLCP48506 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLCP48506 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLCP48506 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCLCP48506 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLCP48506 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLCP48506 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLCP48506 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLCP48506 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLCP48506 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLCP48506 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLCP48506 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLCP48506 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLCP48506 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCLCP48506 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLCP48506 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLCP48506 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLCP48506 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLCP48506 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLCP48506 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLCP48506 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLCP48506 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLCP48506 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLCP48506 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLCP48506 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLCP48506 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCLCP48506 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms