Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNJ1P48048 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNJ1P48048 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNJ1P48048 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms