Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRCC3P46736 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRCC3P46736 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRCC3P46736 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms