Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGIRP43119 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGIRP43119 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms