Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.02
NCAPD3P42695 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC40.13■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
NCAPD3P42695 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC40.07■■■■■ 4
NCAPD3P42695 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
NCAPD3P42695 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC40.07■■■■■ 4
NCAPD3P42695 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
NCAPD3P42695 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC40.07■■■■■ 4
NCAPD3P42695 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC40.07■■■■■ 4
NCAPD3P42695 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
NCAPD3P42695 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NCAPD3P42695 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NCAPD3P42695 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NCAPD3P42695 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NCAPD3P42695 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NCAPD3P42695 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
NCAPD3P42695 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC40.06■■■■■ 4
NCAPD3P42695 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
NCAPD3P42695 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
NCAPD3P42695 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
NCAPD3P42695 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
NCAPD3P42695 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
NCAPD3P42695 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
NCAPD3P42695 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC40.04■■■■■ 4
NCAPD3P42695 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
NCAPD3P42695 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC40.04■■■■■ 4
NCAPD3P42695 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
NCAPD3P42695 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
NCAPD3P42695 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
NCAPD3P42695 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
NCAPD3P42695 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
NCAPD3P42695 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
NCAPD3P42695 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
NCAPD3P42695 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
NCAPD3P42695 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC40.02■■■■■ 4
NCAPD3P42695 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
NCAPD3P42695 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
NCAPD3P42695 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
NCAPD3P42695 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
NCAPD3P42695 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
NCAPD3P42695 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
NCAPD3P42695 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NCAPD3P42695 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.01■■■■□ 3.99
NCAPD3P42695 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC40■■■■□ 3.99
NCAPD3P42695 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NCAPD3P42695 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NCAPD3P42695 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
NCAPD3P42695 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC40■■■■□ 3.99
NCAPD3P42695 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms