Protein–RNA interactions for Protein: P40479

SDP1, Dual-specificity protein phosphatase SDP1, yeastyeast

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SDP1P40479 YCL065WYCL065W 369 nt5.03□□□□□ -1.6
SDP1P40479 CPR4YCR069W 957 nt5.03□□□□□ -1.6
SDP1P40479 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.03□□□□□ -1.6
SDP1P40479 YGL204CYGL204C 306 nt5.03□□□□□ -1.6
SDP1P40479 RRP4YHR069C 1080 nt5.03□□□□□ -1.6
SDP1P40479 MRPL49YJL096W 486 nt5.03□□□□□ -1.6
SDP1P40479 PRP21YJL203W 843 nt5.03□□□□□ -1.6
SDP1P40479 CPR7YJR032W 1182 nt5.03□□□□□ -1.6
SDP1P40479 RPS15YOL040C 429 nt5.03□□□□□ -1.6
SDP1P40479 PDX3YBR035C 687 nt5.03□□□□□ -1.6
SDP1P40479 CMR3YPR013C 954 nt5.03□□□□□ -1.6
SDP1P40479 YBR219CYBR219C 384 nt5.03□□□□□ -1.6
SDP1P40479 REF2YDR195W 1602 nt5.03□□□□□ -1.6
SDP1P40479 VMA13YPR036W 1437 nt5.03□□□□□ -1.6
SDP1P40479 LSG1YGL099W 1923 nt5.03□□□□□ -1.6
SDP1P40479 MNS1YJR131W 1650 nt5.02□□□□□ -1.61
SDP1P40479 CBS1YDL069C 690 nt5.02□□□□□ -1.61
SDP1P40479 RPS16BYDL083C 432 nt5.02□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YRA1YDR381W 681 nt5.02□□□□□ -1.61
SDP1P40479 EFG1YGR271C-A 702 nt5.02□□□□□ -1.61
SDP1P40479 SPO7YAL009W 780 nt5.02□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YPT6YLR262C 648 nt5.02□□□□□ -1.61
SDP1P40479 RPC34YNR003C 954 nt5.02□□□□□ -1.61
SDP1P40479 MEC3YLR288C 1425 nt5.02□□□□□ -1.61
SDP1P40479 DFG5YMR238W 1377 nt5.02□□□□□ -1.61
SDP1P40479 SCT1YBL011W 2280 nt5.02□□□□□ -1.61
SDP1P40479 SNT2YGL131C 4212 nt5.02□□□□□ -1.61
SDP1P40479 UTP18YJL069C 1785 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 CIK1YMR198W 1785 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 TFC7YOR110W 1308 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 SUP45YBR143C 1314 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YEL077CYEL077C 3834 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 CWC21YDR482C 408 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 COBQ0105 1158 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YGL132WYGL132W 336 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YIL025CYIL025C 375 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 MBR1YKL093W 1020 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 COS9YKL219W 1224 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YLR184WYLR184W 348 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 COG5YNL051W 1212 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 CPA1YOR303W 1236 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 RMI1YPL024W 726 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 ARR3YPR201W 1215 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 MRK1YDL079C 1506 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 MIG1YGL035C 1515 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 UTP5YDR398W 1932 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 PRO2YOR323C 1371 nt5.01□□□□□ -1.61
SDP1P40479 NPL4YBR170C 1743 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 RCK2YLR248W 1833 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 PDS1YDR113C 1122 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 HTB1YDR224C 396 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 PRP18YGR006W 756 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 UPS2YLR168C 693 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YAR069CYAR069C 294 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 RRT1YBL048W 312 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YNR062CYNR062C 984 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 PFK27YOL136C 1194 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YOR314WYOR314W 330 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 PNG1YPL096W 1092 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 FDH2YPL275W 711 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 BMT2YBR141C 1014 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 HRP1YOL123W 1605 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YIG1YPL201C 1386 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 NUD1YOR373W 2556 nt5□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YNR066CYNR066C 1311 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 MRS2YOR334W 1413 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 TRK2YKR050W 2670 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 CRD1YDL142C 852 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 UGX2YDL169C 672 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 ATC1YDR184C 885 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 MPO1YGL010W 525 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 CDC43YGL155W 1131 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 DAM1YGR113W 1032 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YHR127WYHR127W 732 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 HMX1YLR205C 954 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 SEC13YLR208W 894 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 ERD2YBL040C 660 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YIM1YMR152W 1098 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 RUF22RUF22 515 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 UAF30YOR295W 687 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 ATG5YPL149W 885 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YCL007CYCL007C 393 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 PMA1YGL008C 2757 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 RNR3YIL066C 2610 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 HSP104YLL026W 2727 nt4.99□□□□□ -1.61
SDP1P40479 HAP1YLR256W 4509 nt4.98□□□□□ -1.61
SDP1P40479 TLG1YDR468C 675 nt4.98□□□□□ -1.61
SDP1P40479 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt4.98□□□□□ -1.61
SDP1P40479 NPY1YGL067W 1155 nt4.98□□□□□ -1.61
SDP1P40479 PEX18YHR160C 852 nt4.98□□□□□ -1.61
SDP1P40479 RHO4YKR055W 876 nt4.98□□□□□ -1.61
SDP1P40479 HUT1YPL244C 1020 nt4.98□□□□□ -1.61
SDP1P40479 OCT1YKL134C 2319 nt4.98□□□□□ -1.61
SDP1P40479 MIC60YKR016W 1623 nt4.97□□□□□ -1.61
SDP1P40479 VPS1YKR001C 2115 nt4.97□□□□□ -1.61
SDP1P40479 MSA1YOR066W 1890 nt4.97□□□□□ -1.61
SDP1P40479 HXT5YHR096C 1779 nt4.97□□□□□ -1.61
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