Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 ATG32YIL146C 1590 nt3.93□□□□□ -1.78
DDI1P40087 ENT1YDL161W 1365 nt3.93□□□□□ -1.78
DDI1P40087 RPS13YDR064W 456 nt3.93□□□□□ -1.78
DDI1P40087 DSD1YGL196W 1287 nt3.93□□□□□ -1.78
DDI1P40087 FRA2YGL220W 363 nt3.93□□□□□ -1.78
DDI1P40087 NSE1YLR007W 1011 nt3.93□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YLR407WYLR407W 687 nt3.93□□□□□ -1.78
DDI1P40087 VPS45YGL095C 1734 nt3.92□□□□□ -1.78
DDI1P40087 FKH1YIL131C 1455 nt3.92□□□□□ -1.78
DDI1P40087 HMG1YML075C 3165 nt3.92□□□□□ -1.78
DDI1P40087 JAC1YGL018C 555 nt3.92□□□□□ -1.78
DDI1P40087 GVP36YIL041W 981 nt3.92□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YLR156WYLR156W 345 nt3.92□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt3.92□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YLR159WYLR159W 345 nt3.92□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YLR161WYLR161W 345 nt3.92□□□□□ -1.78
DDI1P40087 TPP1YMR156C 717 nt3.92□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YOL079WYOL079W 399 nt3.92□□□□□ -1.78
DDI1P40087 NCE102YPR149W 522 nt3.92□□□□□ -1.78
DDI1P40087 MUM3YOR298W 1440 nt3.92□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YTM1YOR272W 1383 nt3.91□□□□□ -1.78
DDI1P40087 MMT1YMR177W 1533 nt3.91□□□□□ -1.78
DDI1P40087 GLN4YOR168W 2430 nt3.91□□□□□ -1.78
DDI1P40087 RPL14AYKL006W 417 nt3.91□□□□□ -1.78
DDI1P40087 URE2YNL229C 1065 nt3.91□□□□□ -1.78
DDI1P40087 FSH3YOR280C 801 nt3.91□□□□□ -1.78
DDI1P40087 UBA3YPR066W 900 nt3.91□□□□□ -1.78
DDI1P40087 FMP25YLR077W 1752 nt3.91□□□□□ -1.78
DDI1P40087 YML020WYML020W 1995 nt3.91□□□□□ -1.78
DDI1P40087 DHH1YDL160C 1521 nt3.9□□□□□ -1.78
DDI1P40087 SPO77YLR341W 1434 nt3.9□□□□□ -1.78
DDI1P40087 NUP133YKR082W 3474 nt3.9□□□□□ -1.79
DDI1P40087 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt3.9□□□□□ -1.79
DDI1P40087 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt3.9□□□□□ -1.79
DDI1P40087 SRB5YGR104C 924 nt3.9□□□□□ -1.79
DDI1P40087 NMA1YLR328W 1206 nt3.9□□□□□ -1.79
DDI1P40087 CIN5YOR028C 888 nt3.9□□□□□ -1.79
DDI1P40087 STP22YCL008C 1158 nt3.9□□□□□ -1.79
DDI1P40087 MLF3YNL074C 1359 nt3.89□□□□□ -1.79
DDI1P40087 PHO12YHR215W 1404 nt3.89□□□□□ -1.79
DDI1P40087 PHO11YAR071W 1404 nt3.89□□□□□ -1.79
DDI1P40087 RTA1YGR213C 954 nt3.89□□□□□ -1.79
DDI1P40087 WSS1YHR134W 810 nt3.89□□□□□ -1.79
DDI1P40087 SPC34YKR037C 888 nt3.89□□□□□ -1.79
DDI1P40087 IES3YLR052W 753 nt3.89□□□□□ -1.79
DDI1P40087 YLR122CYLR122C 378 nt3.89□□□□□ -1.79
DDI1P40087 YGP1YNL160W 1065 nt3.89□□□□□ -1.79
DDI1P40087 RCL1YOL010W 1104 nt3.89□□□□□ -1.79
DDI1P40087 OM14YBR230C 405 nt3.89□□□□□ -1.79
DDI1P40087 GAS2YLR343W 1668 nt3.89□□□□□ -1.79
DDI1P40087 OSH2YDL019C 3852 nt3.89□□□□□ -1.79
DDI1P40087 JHD2YJR119C 2187 nt3.89□□□□□ -1.79
DDI1P40087 OPT2YPR194C 2634 nt3.89□□□□□ -1.79
DDI1P40087 ABP140YOR239W 1887 nt3.88□□□□□ -1.79
DDI1P40087 VMA22YHR060W 546 nt3.88□□□□□ -1.79
DDI1P40087 DBR1YKL149C 1218 nt3.88□□□□□ -1.79
DDI1P40087 ECM15YBL001C 315 nt3.88□□□□□ -1.79
DDI1P40087 SNO1YMR095C 675 nt3.88□□□□□ -1.79
DDI1P40087 TIF5YPR041W 1218 nt3.88□□□□□ -1.79
DDI1P40087 YPR003CYPR003C 2265 nt3.88□□□□□ -1.79
DDI1P40087 SAT4YCR008W 1812 nt3.88□□□□□ -1.79
DDI1P40087 FAS2YPL231W 5664 nt3.88□□□□□ -1.79
DDI1P40087 RIM4YHL024W 2142 nt3.87□□□□□ -1.79
DDI1P40087 RDN5-1RDN5-1 121 nt3.87□□□□□ -1.79
DDI1P40087 RDN5-6RDN5-6 121 nt3.87□□□□□ -1.79
DDI1P40087 SEC72YLR292C 582 nt3.87□□□□□ -1.79
DDI1P40087 NKP2YLR315W 462 nt3.87□□□□□ -1.79
DDI1P40087 YMR130WYMR130W 909 nt3.87□□□□□ -1.79
DDI1P40087 PCL10YGL134W 1302 nt3.87□□□□□ -1.79
DDI1P40087 GIP4YAL031C 2283 nt3.87□□□□□ -1.79
DDI1P40087 NOP8YOL144W 1455 nt3.86□□□□□ -1.79
DDI1P40087 CDC9YDL164C 2268 nt3.86□□□□□ -1.79
DDI1P40087 YCR050CYCR050C 309 nt3.86□□□□□ -1.79
DDI1P40087 OCA4YCR095C 1089 nt3.86□□□□□ -1.79
DDI1P40087 NBP2YDR162C 711 nt3.86□□□□□ -1.79
DDI1P40087 YGR079WYGR079W 1113 nt3.86□□□□□ -1.79
DDI1P40087 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt3.86□□□□□ -1.79
DDI1P40087 YIF1YNL263C 945 nt3.86□□□□□ -1.79
DDI1P40087 SOF1YLL011W 1470 nt3.86□□□□□ -1.79
DDI1P40087 NOP58YOR310C 1536 nt3.85□□□□□ -1.79
DDI1P40087 HCM1YCR065W 1695 nt3.85□□□□□ -1.79
DDI1P40087 PHO13YDL236W 939 nt3.85□□□□□ -1.79
DDI1P40087 HSP31YDR533C 714 nt3.85□□□□□ -1.79
DDI1P40087 PAD1YDR538W 729 nt3.85□□□□□ -1.79
DDI1P40087 YAE1YJR067C 426 nt3.85□□□□□ -1.79
DDI1P40087 AAD10YJR155W 867 nt3.85□□□□□ -1.79
DDI1P40087 UTP23YOR004W 765 nt3.85□□□□□ -1.79
DDI1P40087 EFM2YBR271W 1260 nt3.85□□□□□ -1.79
DDI1P40087 GPI10YGL142C 1851 nt3.85□□□□□ -1.79
DDI1P40087 RSC3YDR303C 2658 nt3.85□□□□□ -1.79
DDI1P40087 RPO31YOR116C 4383 nt3.84□□□□□ -1.79
DDI1P40087 YHR112CYHR112C 1137 nt3.84□□□□□ -1.79
DDI1P40087 OAR1YKL055C 837 nt3.84□□□□□ -1.79
DDI1P40087 REX4YOL080C 870 nt3.84□□□□□ -1.79
DDI1P40087 PRE2YPR103W 864 nt3.84□□□□□ -1.79
DDI1P40087 YPR150WYPR150W 522 nt3.84□□□□□ -1.79
DDI1P40087 YPR174CYPR174C 666 nt3.84□□□□□ -1.79
DDI1P40087 YBR134WYBR134W 402 nt3.84□□□□□ -1.79
DDI1P40087 GDT1YBR187W 843 nt3.84□□□□□ -1.79
DDI1P40087 SWI1YPL016W 3945 nt3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.5 ms