Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGHMBP2P38935 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGHMBP2P38935 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms