Protein–RNA interactions for Protein: P38708

YHR020W, Putative proline--tRNA ligase YHR020W, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR020WP38708 MRM1YOR201C 1239 nt5.46□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YOR314WYOR314W 330 nt5.46□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 IMA1YGR287C 1770 nt5.46□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 HIS4YCL030C 2400 nt5.46□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 APM3YBR288C 1452 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YTM1YOR272W 1383 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 ASH1YKL185W 1767 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 QDR3YBR043C 2070 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 IDP1YDL066W 1287 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 DON1YDR273W 1098 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 VMA22YHR060W 546 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 EST3YIL009C-A 546 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 ECM9YKR004C 1134 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 DCN1YLR128W 810 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 ATG8YBL078C 354 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YOR338WYOR338W 1092 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 COX11YPL132W 903 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 ATG5YPL149W 885 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 BUL1YMR275C 2931 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 CTK1YKL139W 1587 nt5.45□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 RSC30YHR056C 2652 nt5.44□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 SUL2YLR092W 2682 nt5.44□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YCR101CYCR101C 549 nt5.44□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 ERD1YDR414C 1089 nt5.44□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.44□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 FIP1YJR093C 984 nt5.44□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YKR015CYKR015C 1707 nt5.44□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 IRC25YLR021W 540 nt5.44□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 RPS15YOL040C 429 nt5.44□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 RRP7YCL031C 894 nt5.44□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 SOG2YOR353C 2376 nt5.44□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 VHS2YIL135C 1311 nt5.44□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 CTS1YLR286C 1689 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 ARN1YHL040C 1884 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 ART10YLR392C 1557 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 UBA2YDR390C 1911 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 IOC4YMR044W 1428 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 ATP16YDL004W 483 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 RPL35BYDL136W 363 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 COQ4YDR204W 1008 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 SPT15YER148W 723 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 VMA7YGR020C 357 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YJL218WYJL218W 591 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 SMD2YLR275W 333 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 ETT1YOR051C 1239 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 ARL3YPL051W 597 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 snR44snR44 211 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.43□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 TFA1YKL028W 1449 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 NUS1YDL193W 1128 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 RAD55YDR076W 1221 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 MNN10YDR245W 1182 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 RSM27YGR215W 333 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YJL068CYJL068C 900 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 PGA3YML125C 939 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YMR130WYMR130W 909 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YBL059WYBL059W 582 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 BUD17YNR027W 954 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 WRS1YOL097C 1299 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 PIN2YOR104W 849 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 UAF30YOR295W 687 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 BRF1YGR246C 1791 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 ENT1YDL161W 1365 nt5.42□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 RCM1YNL022C 1473 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 NAM9YNL137C 1461 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 COX26YDR119W-A 201 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 MEI4YER044C-A 1227 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 PEF1YGR058W 1008 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YHR127WYHR127W 732 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YUH1YJR099W 711 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 ARX1YDR101C 1782 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 HSF1YGL073W 2502 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 EUG1YDR518W 1554 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 TRE1YPL176C 2352 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 HPC2YBR215W 1878 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 TRK2YKR050W 2670 nt5.41□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 PDC1YLR044C 1692 nt5.4□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 HUL4YJR036C 2679 nt5.4□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 VAC17YCL063W 1272 nt5.4□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 ADY2YCR010C 852 nt5.4□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 RHB1YCR027C 630 nt5.4□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 GIR2YDR152W 798 nt5.4□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YLR317WYLR317W 435 nt5.4□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 YLR339CYLR339C 552 nt5.4□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 IMP2YMR035W 534 nt5.4□□□□□ -1.54
YHR020WP38708 ZUO1YGR285C 1302 nt5.4□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 SIF2YBR103W 1608 nt5.4□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 SHE10YGL228W 1734 nt5.4□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 ALD3YMR169C 1521 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 ALD2YMR170C 1521 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 DSS1YMR287C 2910 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YDL034WYDL034W 345 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 YDR053WYDR053W 396 nt5.39□□□□□ -1.55
YHR020WP38708 CNL1YDR357C 369 nt5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.8 ms