Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLCN1P35523 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN1P35523 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms