Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORAP35398 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORAP35398 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORAP35398 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORAP35398 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORAP35398 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RORAP35398 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORAP35398 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORAP35398 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORAP35398 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORAP35398 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORAP35398 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORAP35398 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORAP35398 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RORAP35398 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORAP35398 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORAP35398 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORAP35398 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORAP35398 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RORAP35398 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORAP35398 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORAP35398 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORAP35398 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORAP35398 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORAP35398 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORAP35398 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORAP35398 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORAP35398 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORAP35398 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORAP35398 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORAP35398 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORAP35398 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RORAP35398 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORAP35398 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORAP35398 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RORAP35398 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORAP35398 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORAP35398 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORAP35398 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORAP35398 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORAP35398 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORAP35398 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORAP35398 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORAP35398 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORAP35398 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORAP35398 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORAP35398 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORAP35398 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORAP35398 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORAP35398 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RORAP35398 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RORAP35398 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORAP35398 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORAP35398 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORAP35398 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORAP35398 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORAP35398 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORAP35398 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RORAP35398 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORAP35398 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORAP35398 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORAP35398 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RORAP35398 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORAP35398 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORAP35398 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RORAP35398 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORAP35398 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORAP35398 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORAP35398 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORAP35398 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORAP35398 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORAP35398 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORAP35398 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RORAP35398 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RORAP35398 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORAP35398 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORAP35398 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RORAP35398 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms