Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.741e-10■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.091e-10■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 FAM222B-212ENST00000583307 886 ntTSL 212.04□□□□□ -0.481e-10■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 FAM222B-204ENST00000577513 731 ntTSL 311.34□□□□□ -0.591e-10■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 FAM222B-214ENST00000583953 564 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.841e-10■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.656e-8■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.676e-8■■■■■ 36.5
GTF2F1P35269 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.457e-11■■■■■ 36.4
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GTF2F1P35269 PSMD13-204ENST00000525665 1632 ntTSL 516.08■□□□□ 0.177e-11■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.117e-11■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.087e-11■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.227e-11■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 PSMD13-208ENST00000528906 858 ntTSL 513.56□□□□□ -0.247e-11■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 PSMD13-205ENST00000526783 892 ntTSL 512.22□□□□□ -0.457e-11■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.782e-6■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 UBE2M-203ENST00000595957 734 ntTSL 215.62■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 SLC16A3-216ENST00000583025 955 ntTSL 221.36■■□□□ 1.012e-9■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 MTG2-207ENST00000471352 785 ntTSL 517.69■□□□□ 0.429e-11■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 MTG2-206ENST00000467101 2814 ntTSL 1 (best)17.03■□□□□ 0.329e-11■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.169e-11■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 MTG2-202ENST00000448254 727 ntTSL 515.24■□□□□ 0.039e-11■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 MTG2-205ENST00000466933 667 ntTSL 314.14□□□□□ -0.159e-11■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.732e-8■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.562e-7■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.282e-7■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 ZNF331-211ENST00000509047 670 ntTSL 316.45■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 ZNF331-221ENST00000514022 913 ntTSL 216.14■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 ZNF331-209ENST00000505426 688 ntTSL 214.86□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 ZNF331-215ENST00000511567 540 ntTSL 414.58□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 ZNF331-207ENST00000504493 641 ntTSL 1 (best)14.08□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 ZNF331-213ENST00000509585 562 ntTSL 513.19□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 36.4
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GTF2F1P35269 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 36.4
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GTF2F1P35269 ZNF331-220ENST00000513999 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 36.4
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GTF2F1P35269 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 ZNF331-205ENST00000502616 573 ntTSL 1 (best)8.94□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.223e-8■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.783e-8■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 BCR-207ENST00000463770 168 ntTSL 1 (best)15.64■□□□□ 0.093e-8■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 BCR-212ENST00000479188 658 ntTSL 415.51■□□□□ 0.073e-8■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 BCR-214ENST00000487679 231 ntTSL 1 (best)9.48□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 PDXK-204ENST00000398078 1069 ntTSL 218.26■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 PDXK-217ENST00000490666 577 ntTSL 516.66■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 PDXK-203ENST00000343528 1101 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 PRKCB-210ENST00000498739 569 ntTSL 418.17■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 36.4
GTF2F1P35269 PDIA5-207ENST00000489923 1651 ntTSL 1 (best)25.6■■□□□ 1.697e-10■■■■■ 36.3
GTF2F1P35269 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.837e-10■■■■■ 36.3
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GTF2F1P35269 MYO18A-207ENST00000530254 6479 ntTSL 1 (best)15.08■□□□□ 0.017e-10■■■■■ 36.3
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GTF2F1P35269 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.397e-10■■■■■ 36.3
GTF2F1P35269 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.417e-10■■■■■ 36.3
GTF2F1P35269 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.437e-10■■■■■ 36.3
GTF2F1P35269 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 36.3
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GTF2F1P35269 IGF2BP3-207ENST00000468263 706 ntTSL 218.38■□□□□ 0.532e-9■■■■■ 36.3
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GTF2F1P35269 IGF2BP3-208ENST00000469723 556 ntTSL 59.45□□□□□ -0.92e-9■■■■■ 36.3
GTF2F1P35269 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.122e-9■■■■■ 36.3
GTF2F1P35269 IGF2BP3-209ENST00000474105 663 ntTSL 45.82□□□□□ -1.482e-9■■■■■ 36.3
GTF2F1P35269 FADS3-205ENST00000526294 550 ntTSL 319.51■□□□□ 0.716e-9■■■■■ 36.3
GTF2F1P35269 FADS3-202ENST00000414624 1452 ntTSL 218.46■□□□□ 0.556e-9■■■■■ 36.3
GTF2F1P35269 IDUA-212ENST00000514698 2185 ntTSL 523.41■■□□□ 1.347e-7■■■■■ 36.3
GTF2F1P35269 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.237e-7■■■■■ 36.3
GTF2F1P35269 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.917e-7■■■■■ 36.3
GTF2F1P35269 CORO7-226ENST00000575531 2636 ntTSL 217.31■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 36.3
GTF2F1P35269 CORO7-217ENST00000572666 1237 ntTSL 517.28■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 36.3
GTF2F1P35269 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.644e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 OSBPL10-205ENST00000452791 485 ntTSL 321.95■■□□□ 1.14e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.334e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 WSB1-217ENST00000584354 544 ntTSL 216.93■□□□□ 0.34e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 WSB1-206ENST00000578312 692 ntTSL 416.78■□□□□ 0.284e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 WSB1-214ENST00000583742 544 ntTSL 416.78■□□□□ 0.284e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 WSB1-203ENST00000427287 1149 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.244e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.244e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 WSB1-207ENST00000579733 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.294e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 WSB1-202ENST00000348811 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.34e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 WSB1-215ENST00000583786 481 ntTSL 512.86□□□□□ -0.354e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 WSB1-209ENST00000581185 1900 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.484e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 WSB1-201ENST00000262394 5139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.484e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 WSB1-211ENST00000582208 625 ntTSL 311.22□□□□□ -0.614e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 WSB1-208ENST00000581089 697 ntTSL 210.88□□□□□ -0.674e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 WSB1-210ENST00000581440 943 ntTSL 310.88□□□□□ -0.674e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 OSBPL10-216ENST00000480671 492 ntTSL 310.7□□□□□ -0.74e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 WSB1-204ENST00000467843 4187 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.764e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 OSBPL10-206ENST00000463504 533 ntTSL 48.48□□□□□ -1.054e-10■■■■■ 36.2
GTF2F1P35269 OSBPL10-207ENST00000465626 473 ntTSL 28.4□□□□□ -1.064e-10■■■■■ 36.2
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