Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL9P32969 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL9P32969 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL9P32969 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL9P32969 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL9P32969 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL9P32969 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL9P32969 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL9P32969 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPL9P32969 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPL9P32969 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RPL9P32969 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPL9P32969 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL9P32969 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL9P32969 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL9P32969 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL9P32969 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL9P32969 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL9P32969 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL9P32969 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL9P32969 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL9P32969 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL9P32969 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL9P32969 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL9P32969 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL9P32969 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL9P32969 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL9P32969 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL9P32969 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL9P32969 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL9P32969 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL9P32969 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL9P32969 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL9P32969 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL9P32969 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL9P32969 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL9P32969 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL9P32969 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL9P32969 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL9P32969 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL9P32969 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL9P32969 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL9P32969 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL9P32969 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL9P32969 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL9P32969 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL9P32969 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL9P32969 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL9P32969 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL9P32969 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL9P32969 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL9P32969 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL9P32969 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL9P32969 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL9P32969 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL9P32969 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL9P32969 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL9P32969 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL9P32969 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL9P32969 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL9P32969 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL9P32969 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL9P32969 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL9P32969 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL9P32969 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL9P32969 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL9P32969 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL9P32969 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL9P32969 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL9P32969 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL9P32969 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL9P32969 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL9P32969 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL9P32969 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL9P32969 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL9P32969 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL9P32969 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL9P32969 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL9P32969 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL9P32969 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL9P32969 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL9P32969 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL9P32969 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL9P32969 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL9P32969 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL9P32969 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL9P32969 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL9P32969 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL9P32969 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL9P32969 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL9P32969 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL9P32969 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL9P32969 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL9P32969 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL9P32969 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL9P32969 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL9P32969 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL9P32969 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL9P32969 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL9P32969 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms