Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKARP32238 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKARP32238 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKARP32238 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKARP32238 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKARP32238 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKARP32238 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKARP32238 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKARP32238 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKARP32238 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKARP32238 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKARP32238 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKARP32238 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKARP32238 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKARP32238 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKARP32238 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKARP32238 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCKARP32238 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCKARP32238 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCKARP32238 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKARP32238 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKARP32238 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKARP32238 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKARP32238 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKARP32238 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKARP32238 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKARP32238 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKARP32238 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKARP32238 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCKARP32238 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCKARP32238 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCKARP32238 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCKARP32238 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCKARP32238 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCKARP32238 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCKARP32238 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCKARP32238 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCKARP32238 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCKARP32238 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCKARP32238 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCKARP32238 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCKARP32238 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCKARP32238 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCKARP32238 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCKARP32238 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCKARP32238 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCKARP32238 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCKARP32238 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCKARP32238 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCKARP32238 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCKARP32238 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCKARP32238 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCKARP32238 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCKARP32238 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCKARP32238 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCKARP32238 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCKARP32238 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCKARP32238 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms