Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASQ1P31415 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASQ1P31415 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CASQ1P31415 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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