Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA9P31269 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms