Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ECHS1P30084 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECHS1P30084 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECHS1P30084 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms