Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LMOD1P29536 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMOD1P29536 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms